Výzkumné skupiny na ústavu

 
Laboratoř aplikované biologie

Laboratoř aplikované biologie

Vedoucí skupiny: prof. Ing. Irena Jarošová, Ph.D. a doc. Ing. Olga Maťátková, Ph.D.

Naše laboratoř se věnuje několika problematikám, jejichž společným základem je přispět k pochopení mechanismů biologické aktivity mikroorganismů a mikrobiálních společenstev. Hlavním cílem je aplikovat získané znalosti v různých oblastech biotechnologie a medicíny pro návrh inhibitorů mikrobiálního růstu, možnosti potlačení tvorby biofilmů, ochrany životního prostředí, ale i průmyslovou výrobu nových přírodních látek a jejich využití. Studujeme i nanočástice, jejich produkci pomocí fyzikálně-chemických i biologických metod a jejich vlastnosti včetně antimikrobiální aktivity. Součástí činnosti laboratoře je i spolupráce s průmyslem a to zejména v oblasti vinařství, se zaměřením na alternativní využití přírodních látek obsažených v rostlinném odpadu. Laboratoř je vybavena řadou moderních bioreaktorových jednotek, je vybavena pro mikrobiologické a biochemické techniky, včetně fluorescenční mikroskopie a analýzy obrazu. Má rovněž přístup k transmisnímu elektronovému mikroskopu, konfokálnímu mikroskopu a hmotnostní spektroskopii.

 
Laboratoř bioinženýrství

Laboratoř bioinženýrství

Vedoucí skupiny: doc. Ing. Martin Halecký, Ph.D.

V Laboratoři bioinženýrství se zabýváme produkčními i dekontaminačními biotechnologiemi z hlediska bioreaktorů, regulace a řízení procesů stejně tak i z hlediska (mikro)biologie, biochemie a genetiky. Pomocí submerzních i biofilmových fotobioreaktorů studujeme využití jednobuněčných mořských i sladkovodních řas a fotosyntetizujících bakterií pro produkci biologicky aktivní látky. Využíváme moderní technologie multispektrální analýzy a 3D skenování pro studium potenciálu mikroorganismů a jejich produktů pro přípravu biopreparátů (biostimulanty a biopesticidy) pro ošetření rostlin v udržitelném zemědělství. Zaměřujeme se i na enzymovou syntézu a recyklaci udržitelných polyuretanových materiálů s maximálním využitím přírodních a obnovitelných surovin s využitím moderních konceptů jako „Green chemistry“, „Cradle-to-grave“ a „Cradle-to-cradle”. Pomocí metod měření kontaktního úhlu a zeta potenciálu studujeme povrchové vlastnosti jak biomasy, tak náplňových a dalších materiálů což dále používáme při studiu tvorby biofilmu, flokulace, flotace a emulzifikace.

Laboratoř mikrobiálních procesů

Laboratoř mikrobiálních procesů

Vedoucí skupiny: prof. Dr. Ing. Petra Patáková

Naše laboratoř se zaměřuje na procesy, ve kterých hrají klíčovou úlohu mikroorganismy. Věnujeme se aerobní i anaerobní kultivaci bakterií, kvasinek a plísní za účelem produkce primárních i sekundárních metabolitů, přičemž fyziologii mikrobiálních populací sledujeme celou řadou technik — od mikroskopie přes průtokovou cytometrii až po metabolomickou a genomovou analýzu. Významnou část naší činnosti tvoří výzkum mikrobiální produkce biopaliv, zejména bioethanolu a biobutanolu, s důrazem na využití lignocelulózových materiálů a zemědělských zbytků jako obnovitelného substrátu. Zabýváme se také přípravou rekombinantních proteinů v kvasinkových expresních systémech a optimalizací kultivačních podmínek pro kontinuální i vsádkové procesy. Součástí naší činnosti je i zhodnocování potravinářských a zemědělských odpadů v biotechnologiích, s cílem přispět k rozvoji udržitelných a oběhových bioprocesů.

  • Stránka skupiny
Laboratoř molekulární biologie

Laboratoř molekulární biologie

Vedoucí skupiny: prof. Dr. Ing. Michaela Rumlová

Největší vědecká pozornost naší laboratoře je věnována problematice virů. Studujeme jednak retroviry, tedy viry, které umí obrátit směr přepisu genetické informace a podle RNA vytvořit DNA a jeden z jejich zástupců HIV způsobuje závažné onemocnění: AIDS; a věnujeme se také studiu flavivirů a to zejména jejich zástupcům viru Dengue, viru klíšťové encefalitidy a viru Zika. Zajímáme se o určitý krok v replikačních cyklech těchto virů, kdy se setká mnoho stovek až tisíců kopií strukturních virových proteinů a virová genetická informace v podobě RNA, a jejich vzájemnými interakcemi se začne vytvářet nová virová částice. Snažíme se pochopit strukturně-funkční mechanismy těchto, pro virus zcela kritických dějů, abychom přišli na to, jak tyto kroky inhibovat a zabránit tak virové infekci.

Laboratoř pivovarství a sladařství

Laboratoř pivovarství a sladařství

Naše skupina se zabývá především výukou, výzkumem a vývojem v oblasti pivovarství a sladařství. Zaštiťujeme výuku celé řady bakalářských i magisterských předmětů a od akademického roku 2026/27 zavádíme novou specializaci Sladařství a pivovarství v rámci magisterského programu Biotechnologie a bioinženýrství. Na výuce se podílejí i externisté a odborníci z pivovarského a sladařského průmyslu, součástí výuky jsou také exkurze do pivovarů a sladoven. Ve výzkumné činnosti věnujeme pozornost širokému spektru témat, která reflektují současné trendy v pivovarství a nacházejí uplatnění v praxi (sekce Vědecké zaměření). K výuce a výzkumné činnosti máme k dispozici zázemí vybavené mimo jiné moderními chromatografickými přístroji, experimentální sladovnou a dále Univerzitní pivovar s automatickou varnou. Studenti se také zapojují do pravidelně pořádaných degustačních tréninků a studentských várek.