Kultivační zařízení

Kultivační zařízení

Pro kultivaci mikroorganismů máme k dispozici široké spektrum bioreaktorů umožňujících aerobní i anaerobní kultivaci, vybavených on-line měřením a regulací pH, O2 v plynech, rozpuštěného O2, redox-potenciálu, CO2, teploty apod.

Submerzní reaktory

  • probublávané kolony pro čištění odpadního vzduchu/vody
  • míchané reaktory B-Braun 0,5–6 l včetně řídících jednotek (2 ks)
  • míchané reaktory Labfors 3,5 l (2 ks) a 7,5 l (1 ks) včetně řídících jednotek
  • míchané reaktory Applikon MiniBio 250 ml V2 (4 ks) včetně řídících jednotek
  • fotobioreaktory – kultivační sestava osvětlených probublávaných válcových reaktorů, třepačka s osvětlením Minitron (kultivace v baňkách nebo na Petriho miskách)
  • OxiTop C s OxiTop Control OC 100

Náplňové reaktory

  • různé typy biofiltrů pro čištění odpadního vzduchu
  • různé typy biofiltrů pro čištění odpadní vody
  • skrápěné kolony (biotrickling filtry) pro čištění odpadního vzduchu
Mikrobiální a tkáňové kultury

Mikrobiální a tkáňové kultury

Mikroskopie

  • fluorescenční mikroskop Nikon Eclipse E 400
  • fluorescenční mikroskop Olympus IX
  • fluorescenční mikroskop Olympus BX40
  • invertovaný světelný mikroskop Olympus CKX31
  • stereomikroskop Nikon SMZ 800
  • analýza obrazu – software NIS-Elements AR 3.0 (Laboratory Imaging)

Průtoková cytometrie

  • Průtokový cytometr se sorterem BD Aria III

Spektrofotometry a čtečky mikrotitračních destiček

  • BIOSCREEN C
  • Infinite M200PRO
  • Hach Lange DR 5000
  • Biochrom Libra S22

Ostatní vybavení

  • laminární boxy
  • anaerobní box
  • CO2 inkubátory
  • počítač buněk II FL
  • lyofilizátor Thermo Heto PowerDry LL3000
  • hlubokomrazící boxy (−70 °C)
  • parní autoklávy (2× AUT 26 Chirana, Tuttnauer ELV 3170 a ELV 3870)
  • třepačky (aerobní/anaerobní, −15–80 °C)
Downstream procesy

Downstream procesy

Downstream procesy

Destilace, rektifikace

  • Náplňová destilační kolona dle Hempla opatřená destilační hlavou pro odběr refluxu a čtyřlitrovým topným hnízdem s čtyřlitrovou destilační baňkou
  • Destilační přístroje dle Marcussona

Odstřeďování

  • Laboratorní odstředivka Sigma 1K15
  • Laboratorní odstředivka Hettich Mikro 220R
  • Laboratorní odstředivka Selecta Medifriger-BL
  • Laboratorní odstředivka Janetzki K26
  • Laboratorní odstředivka Heraeus Megafuge 16R
  • Laboratorní odstředivka Jouan CR3
  • Laboratorní odstředivka Mechanika Precyzyjna MPW-330

Stripování plynem

  • Stripovací aparatura s recyklem stripovacího plynu zajištěném membránovým čerpadlem Secoh MK10, s možností vymražování nebo adsorpce na aktivní uhlí. K aparatuře je možno připojit různé stripovací kolony, nebo přímo laboratorní fermentor. Temperaci zajišťuje termostat Julabo ED 5 a kryostat Julabo MC F25.
Chromatografické analýzy

Chromatografické analýzy

Plynová chromatografie

GC-MS: Agilent 8890 GC System (MSD 5977B + automatický dávkovač PAL3 RSI), Agilent 8890 GC System (MSD 5977C + automatický dávkovač PAL3 RSI Series II)

Obě sestavy využívají systémy PAL3 RSI pro automatizovaný kapalný nástřik, statickou i dynamickou head-space a techniku SPME (Solid Phase Microextraction).

GC-FID, GC-FPD a GC-TCD (Agilent 5890, 6890N)

  • Kvalita a kvantita těkavých polutantů v plynné fázi (těkavé organické látky – VOCs)
  • Kvalita a kvantita těkavých organických látek v alkoholických i nealkoholických nápojích (pivo, víno, lihoviny)
  • Kvalita a kvantita těkavých organických látek v potravinářských surovinách (analýza chmelových silic, tropické ovoce, citrusová kůra)

Vysokotlaká kapalinová chromatografie

Shimadzu Liquid Chromatograph Mass Spectrometer LCMS-8050, HPLC Agilent series 1100, 1200 a 1260 Infinity II (Photo Diode Detector – PDA, RI – Refractive Index detector, Fraction Collector, automatické dávkovače), HPLC Watrex + DAD (Thermo UV6000), RI (KNAUER K2300)

  • Kvalita a kvantita organických látek znečišťujících vodu, půdu a sedimenty (nitroaromatické látky, nitroestery, fenol a jeho deriváty)
  • Kvalita a kvantita organických látek v alkoholických i nealkoholických nápojích (sacharidy, aminokyseliny, iso-hořké kyseliny, polyfenoly)
  • Kvalita a kvantita organických látek potravinářských surovin (chmel – chmelové pryskyřice, ječmen a slad – polyfenoly)
  • Kvalita a kvantita organických látek při studiu buněk a tvorby biofilmu (mastné kyseliny)
  • Stanovení sacharidů, alkoholů a organických kyselin v kapalných vzorcích

Nízkotlaká kapalinová chromatografie

Bio-Rad BioLogic LP s BioFrac Fraction Collector

  • čištění proteinů, peptidů a jiných biomolekul
  • sběr frakcí

Iontová chromatografie

HPLC-IC + vodivostní detektor Shodex CD5

  • Kvalita a kvantita kationtů (Li+, Na+, NH4+, K+, Ca2+, Mg2+)
  • Kvalita a kvantita aniontů (F−, Cl−, NO2−, Br−, NO3−, PO43−, SO42−)
Analýza biopolymerů

Analýza biopolymerů

Proteinová analýza

  • vertikální elektroforéza (BioRad)
  • western blot (BioRad)
  • chlazená CCD kamera (Fusion Fx, Vilber Loumat)
  • promývačka mikrotitračních destiček (HydroFlex, Tecan Life Sciences)
  • multifunkční čtečka mikrotitračních destiček (Infinite M200PRO, Tecan Life Sciences)
  • středotlaký kapalinový chromatograf (Äkta pure 25, GE Healthcare Life Sciences)
  • ultracentrifuga (Optima XPN-90, Beckman Coulter)
  • Diferenciální skenovací fluorimetrie nanoDSF (Prometheus™ Panta) – analytický systém kombinující nanoDSF s dynamickým a statickým rozptylem světla (DLS/SLS) pro komplexní charakterizaci stability proteinů
  • Hybridní čtečka destiček (SpectraMax iD5) – multimode reader spojující pět módů: absorbanci, fluorescenci (top i bottom), luminiscenci, opožděnou fluorescenci (TRF) a fluorescenční polarizaci

PCR cykléry – syntéza a amplifikace DNA

  • BIO RAD T100™ PCR cyklér
  • Life Eco PCR cyklér
  • Applied Biosystems™ QuantStudio™ 5 real-time PCR cyklér, 96jamkové uspořádání

Kvalitativní a kvantitativní analýza RNA/DNA

  • Horizontální elektroforézy: Owl™ EasyCast™ B1A Gel Electrophoresis Systems
  • Dokumentační systém UV/VIS QUANTUM ST5 Vilber Loumat
  • DeNovix DS-11 FX spektrofotometr a fluorimetr
  • Bioanalyzér Agilent 2100
Speciální metody

Speciální metody

Nibem T-Haffmans

Měření stability pěny piva.

Goniometr Krüss DSA30

Automatické stanovení kontaktních úhlů a na základě Young-Laplaceovy rovnice dále povrchového a mezifázového napětí pevných povrchů, nebo buněk po vytvoření tenké vrstvy. Na základě těchto údajů lze vypočítat např. volnou interakční energii adheze buněk.

Multifunkční skenovací zařízení pro multispektrální analýzu a 3D skenování rostlin

Unikátní skenovací zařízení (robotická ruka AR4 vybavená multispektrální kamerou JAI FS-3200D-10GE s objektivem JVS-C118-0824-C3, Revopoint POP 3 3D Scanner a DAHENG IMAGING – MER2-1220-32U3C s objektivem LCM-12MP-06MM-F2.4-1.7-ND1) pro nedestruktivní analýzy rostlin v rámci výzkumu biostimulátorů a biopesticidů.

MicroCal PEAQ-ITC

Přístroj MicroCal PEAQ-ITC je vysoce citlivý izotermální titrační kalorimetr určený k přímému stanovení termodynamických parametrů biomolekulárních interakcí v nativním stavu. Umožňuje simultánní měření vazebné afinity (KD), stechiometrie (n) a entalpie (ΔH) během jediného experimentu, což poskytuje komplexní termodynamický profil interakce (včetně výpočtu entropie ΔS a Gibbsovy volné energie ΔG) bez potřeby fluorescenčního značení nebo imobilizace vzorku.