vrátit změny

Nacházíte se: VŠCHT Praha – FPBT – ÚB → Věda a výzkum → Vědecko-výzkumné skupiny → Laboratoř mikrobiálních procesů

iduzel: 15479
idvazba: 18961
šablona: stranka_obrazek_vertical
čas: 6.6.2023 15:04:26
verze: 5319
uzivatel:
remoteAPIs:
branch: trunk
Server: 147.33.89.153
Obnovit | RAW

iduzel: 15479
idvazba: 18961
---Nová url--- (newurl_...)
domena: 'ub.vscht.cz'
jazyk: 'cs'
url: '/veda-a-vyzkum/skupiny/procesy'
iduzel: 15479
path: 8548/5338/5339/5342/5355/15476/15479
CMS: Odkaz na newurlCMS
branch: trunk
Obnovit | RAW

Laboratoř mikrobiálních procesů

Naše laboratoř se zaměřuje na procesy, ve kterých hrají klíčovou úlohu mikroorganismy, mezi stěžejní činnosti patří zejména:

aerobní a anerobní kultivace bakterií, kvasinek a plísní
produkce primárních a sekundárních metabolitů,
charakteristika mikrobiální populace pomocí fluorescenčních technik
molekulární biologie solventogenních klostridií
produkce sekundárních metabolitů houbou Monascus

Personální obsazení

Řešená témata

Produkce biopaliv a bioplastů

Fermentační produkce biopaliv (ethanolu a butanolu) a prekurzorů pro syntézu bioplastů (kyselina jantarová, mléčná) ze surovin první a druhé generace. Návrh fermentačního procesu v závislosti na použité surovině, určení vhodných kultivačních podmínek a výběr nejvhodnějšího uspořádání procesu (vsádková, přítokovaná a kontinuální kultivace) a pro maximalizaci výtěžnosti a produktivity procesu.

Molekulární biologie solventogenních klostridií

Genové a genomové funkční a komparativní studie se zaměřením na základní výzkum procesu tvorby organických rozpouštědel během ABE fermentace. Vývoj metodik pro genovou manipulaci solventogenních klostridií, sledování genové exprese pomocí qPCR metod a popis průběhu produkce biobutanolu na molekulární úrovni. Výzkum tvorby endospor u klostridií.

Analýza mikrobiálních populací na jednobuněčné úrovni

Využití fluorescenční mikroskopie, průtokové cytometrie a fluorimetrie k podrobné analýze mikrobiálních populací. Sledování viability, růstové dynamiky, enzymové aktivity, koncentrace intracelulárních komponent (DNA, NK, proteiny, PHA, GFP...) a dalších buněčných funkcí pomocí selektivního značení fluorescenčními sondami. Jednotlivé parametry měříme v průběhu kultivačního procesu, za vlivu stresových faktorů či přídavku antimikrobiálních agens u kvasinkových i bakteriálních populací.

Produkce rekombinantních proteinů mikrobiálními producenty

Návrh procesů pro získání hustých kultur mikrobiální biomasy, která po indukci produkuje požadovaný rekombinantní protein. Analýza on-line a off-line měřených veličin, návrh vhodného uspořádání procesu.

Zpracování odpadních materiálů ze zemědělství a průmyslu

Zpracování lignocelulosových materiálů (sláma, dřevo) a materiálů bohatých na keratin (peří) na utilizovatelný substrát a dále na látky s přidanou hodnotou, jakými jsou biopaliva (butanol, etanol), prekurzory bioplastů (kyselina mléčná, kyselina jantarová) a další. Technologie zahrnují fyzikálně-chemické procesy předúpravy materiálu, enzymatický rozklad a produkci metabolitů pomocí mikroorganismů.

Produkce sekundárních metabolitů

Produkce oligoketidových pigmentů houbou Monascus purpureus při kultivaci na pevném substrátu a v kapalném médiu. Optimalizace kultivačních podmínek pro preferenční biosyntézu žlutých pigmentů, monascinu a ankaflavinu. Izolace a stanovení pigmentů, citrininu a monakolinu K. Testování účinku žlutých pigmentů na metabolický syndrom u krys (ve spolupráci s IKEM).

Spolupráce

Aktualizováno: 31.5.2023 12:37, Autor: Martin Halecký

Významné výsledky

Patáková P. et al., Acidogenesis, solventogenesis, metabolic stress response and life cycle changes in Clostridium beijerinckii NRRL B-598 at the transcriptomic level, Scientific Reports 9, 1371, 2019 (on-line)

Sedlar K. et al., Transcription profiling of butanol producer Clostridium beijerinckii NRRL B-598 using RNA-Seq. BMC Genomics 19 (1), 415, 2018 (online)

Branska B. et al., Flow cytometry analysis of Clostridium beijerinckii NRRL B-598 populations exhibiting different phenotypes induced by changes in cultivation conditions. Biotechnology for Biofuels 11:99, 2018 (online)

Patakova P., Kolek J., Sedlář K., Koscova P., Branska B., Kupkova K., Paulova P., Provazník I.: Comparative analysis of high butanol tolerance and production in clostridia, Biotechnology Advances 36(3),721-738, 2018 (online)

Sedlar K., Kolek J., Provaznik I., Patakova P.: Reclassification of non-type strain Clostridium pasteurianum NRRL B-598 as Clostridium beijerinckii NRRL B-598. Journal of Biotechnology 244(20), 1-3 (2017) (online)

Kolek J., Sedlar K., Provaznik I., Patakova P. Dam and Dcm methylations prevent gene transfer into Clostridium pasteurianum NRRL B-598: development of methods for electrotransformation, conjugation and sonoporation. Biotechnology for Biofuels (2016) 9:14.DOI 10.1186/s13068-016-0436-y, (open access)

Paulová L., Patáková P., Branská B., Rychtera M., Melzoch K.: Lignocellulosic ethanol: Technology design and its impact on process efficiency. Biotechnology Advances. doi:10.1016/j.biotechadv.2014.12.002 (on-line)

Kolek J., Patakova P., Melzoch K., Sigler K., Řezanka T. Changes in membrane plasmalogens of Clostridium pasteurianum during butanol fermentation as determined by lipidomic analysis. PLOS ONE 10.1371/journal.pone.0122058 (2015)

Patáková P., Linhová M., Vykydalová P., Branská B., Rychtera M., Melzoch K.: Use of fluorescent staining and flow cytometry for monitoring physiological changes in solventogenic clostridia. Anaerobe 29: 113-117 (2014), ISSN 1075-9964, IF 2,022 (on-line)

Paulova L., Hyka P., Branska B., Melzoch K., Kovar K.: Use of a mixture of glucose and methanol as substrates for the production of recombinant trypsinogen in continuous cultures with Pichia pastoris Mut(+). Journal of Biotechnology 157 (1): 180-188 (2012). (on-line)

Patáková P.: Monascus secondary metabolites: production and biological activity. Journal of Industrial Microbiology and Biotechnology 40(2): 169-181. (2013) (on-line)

Paulová L., Patáková P., Rychtera M., Melzoch K.: High solid fed-batch SSF with delayed inoculation for improved production of bioethanol from wheat straw. Fuel 122: 294-300. (2014) IF 3,406 (on-line)

Poloprovoz_Bioraf

×