Od roku 2021 se také zabýváme studiem a možnostmi inhibice replikace virové RNA SARS-CoV-2. Vzhledem k tomu, že SARS-CoV-2 kóduje vlastní proteiny podílející se na opravných mechanismech mutací, vznikajících během replikace viru, je použití nukleosidových analogů jako antivirotik pro léčbu COVID-19 značně limitované. Zaměřujeme se proto na charakterizaci potenciální alosterické inhibice RNA-dependentní RNA polymerasy (RdRp) a screening vazebné aktivity malých sloučenin, které vykazují inhibiční efekt. Dále se zabýváme in vitro analýzou přirozeně se vyskytujících mutací v oblastech RdRp, jejichž výskyt souvisí s různými variantami SARS-CoV-2, které byly v posledních třech letech opakovaně hlášeny u RdRp kofaktorů (nsp7, nsp8 a nsp12). Našim dalším cílem je exoribonukleasový komplex, zodpovědný za opravnou aktivitu SARS-CoV-2. Inhibice aktivity tohoto komplexu, skládajícího se z exoribonukleasové domény a jejího kofaktoru, se v rámci replikace virové RNA jeví jako slibný přístup ke zvýšení účinnosti inhibitorů aktivního místa RdRp.
Zdroj: Glaunsinger Lab: Jessica M Tucker, Britt A Glaunsinger et al (Content Experts)
Grantová podpora: GAČR 2022-2024
Spolupráce: Ústav biochemie a mikrobiologie VŠCHT Praha, ÚOCHB AV ČR