doc. Ing. Barbora Branská, Ph.D.
Kontakty
| místnost: | AS55 |
| telefon: | +420 220 44 5016 |
| e-mail: | barbora.branska@vscht.cz |
| vědecké identifikátory | ResearcherID: G-6429-2019 Scopus ID: 45560997100 ORCID: 0000-0001-6536-7063 RIV vedidk: 5757770 |
Vzdělání a zkušenosti
| 1997–2002 | Magisterské studium, VŠCHT Praha, Biochemie a biotechnologie (Ing.) |
| 2002–2007 | Doktorské studium, VŠCHT Praha, Biochemie a biotechnologie (Ph.D.) |
| 2007-2023 | Odborný asistent na VŠCHT Praha, ÚB |
| 2023-dosud | Docent v oboru biotechnologie, VŠCHT Praha, ÚB |
Pedagogika
- výuka buněčné biologie a podíl na výuce biotechnologických předmětů pro bakalářské a mkých i anglických studijních programech
- vedoucí bakalářských, magisterských a doktorských kvalifikačních prací
Věda a výzkum
- Biotechnologická produkce biopaliv a dalších látek s přidanou hodnotou z obnovitelných
- Využití nestandardních substrátů
- Design biotechnologických procesů aerobní/anaerobní kultivace mikroorganismů
- Studium fyziologie mikroorganismů, analýza mikrobiálních populací pomocí světelné mikroskopie, fluorescenční mikroskopie, průtokové cytometrie, fluorimetrie, ve spojení s transkriptomickou analýzou
Účast na projektech v posledních 5 letech:
- Inhibitors from bio-waste processing: challenge or opportunity for biotechnological prclostridia? GA23-06941S, poskytovatel: GAČR, Standardní projekty, řešitel: doc. Ing.Barbora Branská, Ph.D., období řešení: 2023-2025
- Nová řešení v oblasti snižování energetické náročnosti a snižování emisí v biorafinačnví, TN02000044/01, poskytovatel TAČR, program NPO, řešitel: Ing. Olga Šolcová, DSc., období řešení: 2023-6/2026
- Biorafinace a cirkulární ekonomika pro udržitelnost (BIOCIRKL), TN02000044, poskytovatitel: Ing. Olga Šolcová, DSc., období řešení: 2023-2028
- Národní Centrum kompetence „Biorafinace jako oběhové technologie“ (TN01000048), poskytovatel TAČR, hlavní řešitel Ing. Olga Šolcová, DSc., období řešení: 2019-2022
- Vztah mezi efluxem butanolu a tolerancí k butanolu u klostridií, č. 17-00551S, Poskyto P. Patáková, spoluřešitel: prof. I. Provazník, PhD, VUT Brno, období řešení 2017-2019
- Výroba butanolu a kyseliny jantarové/mléčné z lignocelulózové biomasy, LTACH 17006, poskytovatel MŠMT, hlavní řešitel: prof. Melzoch K., období řešení: 2017-2019
- Centrum kompetence pro výzkum biorafinací TE01020080, hlavní řešitel Ing. Olga Šolcová, CSc., DSc., období řešení: 2012 - 2019
Publikační a realizační činnost:
Publikace ve vědeckých časopisech:
Kolek, J; Driml, M; Kumzák, M; Soukup, P; Szendzielarz, F; Simera, M; Branská, B; Patáková, P. Use of common carp waste for pigment production by Monascus purpureus. Kvasny Prumysl 2023, Volume 69, pp. 686-691. DOI10.18832/kp2023.69.686
Petra Patakova, Barbora Branska, Maryna Vasylkivska, Katerina Jureckova, Jana Musilova, Ivo Provaznik, Karel Sedlar, Transcriptomic studies of solventogenic clostridia, Clostridium acetobutylicum and Clostridium beijerinckii. Biotechnology Advances 2022, Vo4-9750, https://doi.org/10.1016/j.biotechadv.2021.107889, IF 14,227; počet citací 0
Sedlar K., Nykrynova M., Bezdicek M., Branska B., Lengerova M., Patakova P., Skutkova H. Diversity and Evolution of Clostridium beijerinckii and Complete Genome of the Type Strain DSM 791(T).Processes 2021, 9(7), 1196, IF 2,847, Q3, OA
Sedlar K., Vasylkivska M., Musilova J., Branska B., Provaznik I., Patakova P. Phenotypic and genomic analysis of isopropanol and 1,3-propanediol producer Clostridium diolis DSM 15410. Genomic2021, 113(1), 1109-1119, IF 5,739, Q1.
Jureckova K., Raschmanova H., Kolek J., Vasylkivska M., Branska B., Patakova P., Provaznik I. Identification and validation of reference genes in Clostridium beijerinckii NRRL B-598 for RT-qPusing RNA-Seq data. Frontiers in Microbiology 2021, 12, 640054, OA, Q1, IF 5,640
Husakova, M., Plechata, M., Branska, B., Patakova, P. , Effect of a Monascus sp. Red Yeast Rice Extract on Germination of Bacterial Spores, Frontiers in Microbiology, 2021, 12 (1254). OA, Q1,5,640
Branska B., Vasylkivska M., Raschmanova H., Jureckova K., Sedlar K., Provaznik I., Patakova P. (2020) Changes in efflux pump activity of Clostridium beijerinckii throughout ABE fermentation. Applied Microbiology and Biotechnology, https://doi.org/10.1007/s00253-020-11072-2
Patakova, P., Kolek, J., Jureckova, K., Branska, B., Sedlar, K., Vasylkivska, M. and Provaznik, I. (2020), Deeper below the surface—transcriptional changes in selected genes of Clostridium beijerinckii in response to butanol shock. MicrobiologyOpen e1146. https://doi.org/10
Vasylkivska Maryna, Branska Barbora, Sedlar Karel, Jureckova Katerina, Provaznik Ivo, Patakova Petra. Phenotypic and Genomic Analysis of Clostridium beijerinckii NRRL B-598 Mutants With Increased Butanol Tolerance, Front. Bioeng. Biotechnol., 05 November 2020 | https://doi.or92
Paulova L., Chmelik J., Branska B., Patakova P., Drahokoupil M., Melzoch K. Comparison of Lactic Acid Production by L. casei in Batch, Fed-batch and Continuous Cultivation, Testing the use ofFeather Hydrolysate as a Complex Nitrogen Source. Braz. arch. biol. technol. (2020) 63: e2
Branska B., Fořtová L., Dvořáková M., Liu H, Patakova P., Zhang J, Melzoch M, Chicken feather and wheat straw hydrolysate for direct utilization in biobutanol production, Renewable Energy,Volume 145, 2020, p. 1941-1948,ISSN 0960-1481,https://doi.org/10.1016/j.renene.2019.07.094.
Sedlar K, Kolek J, Gruber M, Jureckova K, Branska B, Csaba G, Vasylkivska M, Zimmer R, Patakova P, Provaznik I. A transcriptional response of Clostridium beijerinckii NRRL B-598 to a butanol shock. Biotechnol Biofuels. 2019 Oct 13;12:243. doi: 10.1186/s13068-019-1584-7. PMID: 3163/p>
Vasylkivska M, Jureckova K, Branska B, Sedlar K, Kolek J, Provaznik I, Patakova P. Transcriptional analysis of amino acid, metal ion, vitamin and carbohydrate uptake in butanol-producing Clostridiumbeijerinckii NRRL B-598. PLoS One. 2019 Nov 7;14(11):e0224560. doi: 10.1371/journal.p92; PMCID: PMC6837493.
Patrovsky M, Sinovska K, Branska B, Patakova P. Effect of initial pH, different nitrogen sources, and cultivation time on the production of yellow or orange Monascus purpureus pigments and the mycotoxin citrinin. Food Sci Nutr. 2019 Sep 27;7(11):3494-3500. doi: 10.1002/fsn3.1197. PM848812.
Lin, Z., Liu, H., Wu, J., Patakova, P., Branska, B., Zhang, J. Effective continuous acetone–butanol–ethanol production with full utilization of cassava by immobilized symbiotic TSH06. Biotechnol Biofuel12, 219 (2019) doi:10.1186/s13068-019-1561-1
Patakova P.; Branska B.; Sedlar K.; Vasylkivska M.; Jureckova K.; Kolek J.; Koscova P.; Provaznik I., Acidogenesis, solventogenesis, metabolic stress response and life cycle changes in Clostridium beijerinckii NRRL B-598 at the transcriptomic level. Scientific reports 2019, 9(1), 1
Sedlář K., Koščová P., Vasylkivska M., Branska B., Kolek J., Kupková K., Patáková P., Provazník I.: Transcription profiling of butanol producer Clostridium beijerinckii NRRL B-598 using RNA-SeqBMC Genomics 19(1):415 (2018), IF 3,73, Q1
Raschmanová, H., Paulová, L., Branská, B. Knejzlík Z, Melzoch K, Kovar K. Production and cleavage of a fusion protein of porcine trypsinogen and enhanced green fluorescent protein (EGFP) in Pichia pastoris Folia Microbiol (2018) 63: 773
Gharwalová L, Paulová L, Patáková P, Branská B, Melzoch K. Use of wheat straw and chicken feather hydrolysates as a complete medium for lactic acid production. Czech J Food Sci. 2018;36(2).
Branska B, Pechacova Z, Kolek J, Vasylkivska M, Patakova P. Flow cytometry analysis of kii NRRL B-598 populations exhibiting different phenotypes induced by changes incultivation conditions. Biotechnol Biofuels 2018 Dec 6 11(1):99
Kolek J, Diallo M, Vasylkivska M, Branska B, Sedlar K, López-Contreras AM, et al. Compay sporulation, solventogenic and acetogenic genes in C. beijerinckii NRRL B-598and its mutant strain overexpressing spo0A. Appl Microbiol Biotechnol. 2017;101(22).
Patakova P, Kolek J, Sedlar K, Koscova P, Branska B, Kupkova K, et al. Comparative analrance and production in clostridia. Biotechnol Adv. 2017
Kolek J, Branska B, Drahokoupil M, Patakova P, Melzoch K. Evaluation of viability, metabolic activity and spore quantity in clostridial cultures during ABE fermentation. FEMS Microbiol Lett. 2016;363(6).
Stiborova H, Branska B, Vesela T, Lovecka P, Stranska M, Hajslova J, et al. Transformation of raw feather waste into digestible peptides and amino acids. J Chem Technol Biotechnol. 2016;91(6).
Paulová P., Patáková P., Branská B., Rychtera M., Melzoch K.: Lignocellulosic ethanol: impact on process efficiency. Biotechnol. Adv. 33: 1091-1107 (2015). IF 9,015
Sedlář K., Kolek J., Škutková H., Branská B., Provazník I., Patáková P.: Complete genome sequence of Clostridium pasteurianum NRRL B-598, a non-type strain producing butanol. J. Biotechnol. 214113-114 (2015). IF 2,871
Gallazzi A., Branská B., Marinelli F., Patakova P.: Continuous production of n-butanol by Clostridium pasteurianum DSM 525 using suspended and surface-immobilized cells. J. Biotechnol. 216: 29-35 (2015). IF 2,871
Patakova P., Linhova M., Vykydalova P., Branska B., Rychtera M., Melzoch K., Use of fluorescent staining and flow cytometry for monitoring physiological changes in solventogenic clostridia, Anaerobe 29,113-117 (2014)
Linhová M., Branská B., Patáková P., Lipovský J., Fribert P., Rychtera M., Melzoch K., Rapid flow cytometric method for viability determination of solventogenic clostridia, Folia Microbiol. 57, 307-311 (2012)
Branská B., Linhová L., Patáková P., Paulová L., Melzoch K.: Stanovení viability mikroorganismů pomocí fluorescenční analýzy. Chem. Listy 105, 586-593 (2011). ISSN 0009-2770
Paulová L., Hyka P., Branská B., Melzoch K., Kovar K.: Use of a mixture of glucose and r the production of recombinant trypsinogen in continuous cultures with Pichiapastoris Mut+. J. Biotechnol. 157(1) 180-188 (2011), ISSN: 0168-1656
Application of flow cytometry to Saccharomyces cerevisiae population analysis K; Paulova, L; et al. CHIMIA Volume: 59 Issue: 10 Pages: 745-748 Published: 2005
Electrodialysis as a useful technique for lactic acid separation from a model solution and a fermentation broth By: Habova, V; Melzoch, K; Rychtera, M; et al. Conference: PERMEA 2003 Conference LocationTatranske Matiliare, SLOVAKIA Date: SEP 07-11, 2003 DESALINATION Volume: 162 Issue: 1-3 Paer: PII S0011-9164(04)00070-0 Published: MAR 10 2004
Thermophilic bacteria colony growth and its consequences in the food industry By: Melzoch, K; Votruba, J; Sekavova, B; et al. CZECH JOURNAL OF FOOD SCIENCES Volume: 22 Issue: 1 Pages: 1-8 Published: FEB2004
Kapitoly v knihách:
Chapter 8 - Microbial production of butanol from food industry waste, in Food Industry Wastes: Assessment and Recuperation of Commodities, Patakova P. , Branska B. , Lin Z. , Wu P. , Zhou Y. , Drahokoupil M. , Liu H. , Zhang J., Melzoch K. 2nd edition, Kosseva V., Webb C. c Press, 2020, Pages 163-180, ISBN 9780128171219,
Comparison of Suspended and Surface-immobilized Clostridium pasteurianum
Branska B., Patakova P., Melzoch K. In: BIOREFINING in the 21st Century, Editors: Olga Šolcová, Jiří Hanika, Pavel Topka, ISBN: 978-80-86186-02-3
Application of Flow Cytometry in Analysis of Fitness of Microbial Producers Editors: OlgaŠolcová, Jiří Hanika, Pavel Topka, ISBN: 978-80-86186-02-3
Patakova P, Branska B, Patrovsky M. Monascus Secondary Metabolites. In: Merillrs. Fungal Metabolites. Cham: Springer International Publishing; 2016. p. 1–31
Aplikované výstupy
Patenty:
Patáková P., Branská B., Paulová L., Stiborová H., Lovecká P. a další, Úplné kultivační médium pro mikrobiální produkci etanolu nebo butanolu, způsoby jeho výroby a způsoby výroby etanolu a butanolu, CZPatent č.306795, VŠCHT Praha, Briklis s.r.o., EcoFuel Laboratories, s.r.o., datum udělení
Lovecká P., Vrchotová B., Demnerová K., Stiborová H., Patáková P., Branská B., Kaštánek P., Jandejsek Z., Fulín T., Způsob produkce polyhydroxyalkanoátů z vedlejších živočišných produktů. CZ Patent č. 308902, datum udělení 7.7. 2021.
Užitné vzory:
Drahokoupil M., Branská B., Paulová L., Patáková P., Melzoch K., Kaštánek P., Kronusová O., Jandejsek Z. Zařízení pro odběr suspenzních anaerobních vzorků z bioreaktoru. PUV 2018-35299
Branská B., Patáková P., Stiborová H., Lovecká P., Demnerová K., Melzoch K., Jandejsek žka kultivačních médií pro mikroorganismy. PUV 2019-36153.
Branská B., Patáková P., Melzoch K., Jandejsek Z. Probiotický přípravek pro psy na bázi vedlejších živočišných produktů. Užitný vzor, PUV 2022-39725, UV 36 249, zapsán 9.8. 2022
Funkční vzorek, Gfunk:
Branská B., Hajlová J., Jírů J., Kolek J., Melzoch M., Patáková P., Patrovský M., Paulonek P., Svátek A. Úplné kultivační médium pro mikrobiální produkci etanolu nebo butanolu.2016 Fukční vzorek: RIV/60461373:22330/16:43913484
Branská B., Drahokoupil M., Melzoch K., Patáková P.,, Hybridní bioreaktor pro kontinuálny z odpadních surovin v kombinovaném submersním a imobilizovaném uspořádání. Funkčnívzorek: RIV/60461373:22330/19:43918374
Branská B., Melzoch K., Patáková P., Jandejsek Z.. Probiotický přípravek pro psy vyrobehydrolýze vedlejších živočišných produktů, 2020, Funkční vzorekRIV/60461373:22330/20:43921121.
Branská B., Melzoch K., Patáková P., Jandejsek Z. Probiotického přípravku pro psy z hydí drůbeže. Funkční vzorek, 2021. RIV/60461373:22330/21:43922815
Ověřené technologie:
Paulová L., Branská B., Melzoch K. - Zavedení technologie přítokované kultivace kvasinky Pichia pastoris pro produkci rekombinantího proteinu (2008). Ověřená technologie. RIV/60461373:22330/08:00021084
Branská B., Patáková P., Drahokoupil M., Melzoch K., Přímé zpracování obtížně fermentovatelných lignocelulózových hydrolyzátů na biobutanol přítokovanou kultivací. 2019, Ověřená technologie. RIV/60461373:22330/19:43918377Smlouva o využití výsledků výzkumu a vývoje č.107-2019.
Poloprovozy:
Branská B., Drahokoupil M., Patáková P., Vasylkivska M., Paulová L., Melzoch K., Jandejsek Z., Fulín T., Svátek A., Kaštánek P.: Hydrolýza a frakcionace lignocelulosových materiálů. Poloprovoz. 2017 RIV/60461373:22330/17:43913302
Drahokoupil M., Branská B., Vasylkivska M., Patáková P., Melzoch K., Jandejsek Z., Fulín T., Kaštánek P., Svátek A. Produkce kyseliny mléčné ze zemědělských a potravinářských odpadů, Poloprovoz., 2018. RIV/60461373:22330/19:43918379
Zájmy
Hory a bílé víno.