doc. Ing. Barbora Branská, Ph.D.

Publikace ve vědeckých časopisech: 

Kolek, J;  Driml, M; Kumzák, M; Soukup, P; Szendzielarz, F; Simera, M; Branská, B; Patáková, P. Use of common carp waste for pigment production by Monascus purpureus. Kvasny Prumysl 2023, Volume 69, pp. 686-691. DOI10.18832/kp2023.69.686  

Petra Patakova, Barbora Branska, Maryna Vasylkivska, Katerina Jureckova, Jana Musilova, Ivo Provaznik, Karel Sedlar, Transcriptomic studies of solventogenic clostridia, Clostridium acetobutylicum and Clostridium beijerinckii. Biotechnology Advances 2022, Volume 58, 107889, ISSN 0734-9750, https://doi.org/10.1016/j.biotechadv.2021.107889, IF 14,227; počet citací 0  

Sedlar K., Nykrynova M., Bezdicek M., Branska B., Lengerova M., Patakova P., Skutkova H. Diversity and Evolution of Clostridium beijerinckii and Complete Genome of the Type Strain DSM 791(T). Processes 2021, 9(7), 1196, IF 2,847, Q3, OA  

Sedlar K., Vasylkivska M., Musilova J., Branska B., Provaznik I., Patakova P. Phenotypic and genomic analysis of isopropanol and 1,3-propanediol producer Clostridium diolis DSM 15410. Genomics 2021, 113(1), 1109-1119, IF 5,739, Q1.  

Jureckova K., Raschmanova H., Kolek J., Vasylkivska M., Branska B., Patakova P., Provaznik I. Identification and validation of reference genes in Clostridium beijerinckii NRRL B-598 for RT-qPCR using RNA-Seq data. Frontiers in Microbiology 2021, 12, 640054, OA, Q1, IF 5,640  

Husakova, M., Plechata, M., Branska, B., Patakova, P. , Effect of a Monascus sp. Red Yeast Rice Extract on Germination of Bacterial Spores, Frontiers in Microbiology, 2021, 12 (1254). OA, Q1, IF 5,640  

Branska B., Vasylkivska M., Raschmanova H., Jureckova K., Sedlar K., Provaznik I., Patakova P. (2020) Changes in efflux pump activity of Clostridium beijerinckii throughout ABE fermentation. Applied Microbiology and Biotechnology, https://doi.org/10.1007/s00253-020-11072-2  

Patakova, P., Kolek, J., Jureckova, K., Branska, B., Sedlar, K., Vasylkivska, M. and Provaznik, I. (2020), Deeper below the surface—transcriptional changes in selected genes of Clostridium beijerinckii in response to butanol shock. MicrobiologyOpen e1146. https://doi.org/10.1002/mbo3.1146  

Vasylkivska Maryna, Branska Barbora, Sedlar Karel, Jureckova Katerina, Provaznik Ivo, Patakova Petra. Phenotypic and Genomic Analysis of Clostridium beijerinckii NRRL B-598 Mutants With Increased Butanol Tolerance, Front. Bioeng. Biotechnol., 05 November 2020 | https://doi.org/10.3389/fbioe.2020.598392  

Paulova L., Chmelik J., Branska B., Patakova P., Drahokoupil M., Melzoch K. Comparison of Lactic Acid Production by L. casei in Batch, Fed-batch and Continuous Cultivation, Testing the use of Feather Hydrolysate as a Complex Nitrogen Source. Braz. arch. biol. technol. (2020)  63: e20190151. IF 0,579 Q4  

Branska B., Fořtová L., Dvořáková M., Liu H, Patakova P., Zhang J, Melzoch M, Chicken feather and wheat straw hydrolysate for direct utilization in biobutanol production, Renewable Energy,Volume 145, 2020, p. 1941-1948,ISSN 0960-1481,https://doi.org/10.1016/j.renene.2019.07.094.   

Sedlar K, Kolek J, Gruber M, Jureckova K, Branska B, Csaba G, Vasylkivska M, Zimmer R, Patakova P, Provaznik I. A transcriptional response of Clostridium beijerinckii NRRL B-598 to a butanol shock. Biotechnol Biofuels. 2019 Oct 13;12:243. doi: 10.1186/s13068-019-1584-7. PMID: 31636702; PMCID: PMC6790243.  

Vasylkivska M, Jureckova K, Branska B, Sedlar K, Kolek J, Provaznik I, Patakova P. Transcriptional analysis of amino acid, metal ion, vitamin and carbohydrate uptake in butanol-producing Clostridium beijerinckii NRRL B-598. PLoS One. 2019 Nov 7;14(11):e0224560. doi: 10.1371/journal.pone.0224560. PMID: 31697692; PMCID: PMC6837493.  

Patrovsky M, Sinovska K, Branska B, Patakova P. Effect of initial pH, different nitrogen sources, and cultivation time on the production of yellow or orange Monascus purpureus pigments and the mycotoxin citrinin. Food Sci Nutr. 2019 Sep 27;7(11):3494-3500. doi: 10.1002/fsn3.1197. PMID: 31763000; PMCID: PMC6848812.  

Lin, Z., Liu, H., Wu, J., Patakova, P., Branska, B., Zhang, J. Effective continuous acetone–butanol–ethanol production with full utilization of cassava by immobilized symbiotic TSH06. Biotechnol Biofuels 12, 219 (2019) doi:10.1186/s13068-019-1561-1  

Patakova P.; Branska B.; Sedlar K.; Vasylkivska M.; Jureckova K.; Kolek J.; Koscova P.; Provaznik I., Acidogenesis, solventogenesis, metabolic stress response and life cycle changes in Clostridium beijerinckii NRRL B-598 at the transcriptomic level. Scientific reports 2019, 9(1), 1371.  

Sedlář K., Koščová P., Vasylkivska M., Branska B., Kolek J., Kupková K., Patáková P., Provazník I.: Transcription profiling of butanol producer Clostridium beijerinckii NRRL B-598 using RNA-Seq. BMC Genomics 19(1):415 (2018), IF 3,73, Q1  

Raschmanová, H., Paulová, L., Branská, B. Knejzlík Z, Melzoch K, Kovar K. Production and cleavage of a fusion protein of porcine trypsinogen and enhanced green fluorescent protein (EGFP) in Pichia pastoris Folia Microbiol (2018) 63: 773  

Gharwalová L, Paulová L, Patáková P, Branská B, Melzoch K. Use of wheat straw and chicken feather hydrolysates as a complete medium for lactic acid production. Czech J Food Sci. 2018;36(2).   

Branska B, Pechacova Z, Kolek J, Vasylkivska M, Patakova P. Flow cytometry analysis of Clostridium beijerinckii NRRL B-598 populations exhibiting different phenotypes induced by changes in cultivation conditions. Biotechnol Biofuels 2018 Dec 6 11(1):99  

Kolek J, Diallo M, Vasylkivska M, Branska B, Sedlar K, López-Contreras AM, et al. Comparison of expression of key sporulation, solventogenic and acetogenic genes in C. beijerinckii NRRL B-598 and its mutant strain overexpressing spo0A. Appl Microbiol Biotechnol. 2017;101(22).  

Patakova P, Kolek J, Sedlar K, Koscova P, Branska B, Kupkova K, et al. Comparative analysis of high butanol tolerance and production in clostridia. Biotechnol Adv. 2017  

Kolek J, Branska B, Drahokoupil M, Patakova P, Melzoch K. Evaluation of viability, metabolic activity and spore quantity in clostridial cultures during ABE fermentation. FEMS Microbiol Lett. 2016;363(6).   

Stiborova H, Branska B, Vesela T, Lovecka P, Stranska M, Hajslova J, et al. Transformation of raw feather waste into digestible peptides and amino acids. J Chem Technol Biotechnol. 2016;91(6).   

Paulová P., Patáková P., Branská B., Rychtera M., Melzoch K.: Lignocellulosic ethanol: Technology design and its impact on process efficiency. Biotechnol. Adv. 33: 1091-1107 (2015). IF 9,015  

Sedlář K., Kolek J., Škutková H., Branská B., Provazník I., Patáková P.: Complete genome sequence of Clostridium pasteurianum NRRL B-598, a non-type strain producing butanol. J. Biotechnol. 214: 113-114 (2015). IF 2,871  

Gallazzi A., Branská B., Marinelli F., Patakova P.: Continuous production of n-butanol by Clostridium pasteurianum DSM 525 using suspended and surface-immobilized cells. J. Biotechnol. 216: 29-35 (2015). IF 2,871  

Patakova P., Linhova M., Vykydalova P.,  Branska B., Rychtera M., Melzoch K., Use of fluorescent staining and flow cytometry for monitoring physiological changes in solventogenic clostridia, Anaerobe 29, 113-117 (2014)   

Linhová M., Branská B., Patáková P., Lipovský J., Fribert P., Rychtera M., Melzoch K., Rapid flow cytometric method for viability determination of solventogenic clostridia, Folia Microbiol. 57, 307-311 (2012)  

Branská B., Linhová L., Patáková P., Paulová L., Melzoch K.: Stanovení viability mikroorganismů pomocí fluorescenční analýzy. Chem. Listy 105, 586-593 (2011). ISSN 0009-2770  

Paulová L., Hyka P., Branská B., Melzoch K., Kovar K.: Use of a mixture of glucose and methanol as substrates for the production of recombinant trypsinogen in continuous cultures with Pichia pastoris Mut+. J. Biotechnol. 157(1) 180-188 (2011), ISSN: 0168-1656  

Application of flow cytometry to Saccharomyces cerevisiae population analysis By: Sekavova, B; Melzoch, K; Paulova, L; et al. CHIMIA  Volume: 59   Issue: 10   Pages: 745-748   Published: 2005   

Electrodialysis as a useful technique for lactic acid separation from a model solution and a fermentation broth By: Habova, V; Melzoch, K; Rychtera, M; et al. Conference: PERMEA 2003 Conference Location: Tatranske Matiliare, SLOVAKIA Date: SEP 07-11, 2003 DESALINATION  Volume: 162   Issue: 1-3   Pages: 361-372   Article Number: PII S0011-9164(04)00070-0   Published: MAR 10 2004   

Thermophilic bacteria colony growth and its consequences in the food industry By: Melzoch, K; Votruba, J; Sekavova, B; et al. CZECH JOURNAL OF FOOD SCIENCES  Volume: 22   Issue: 1   Pages: 1-8 Published: FEB 2004   

Kapitoly v knihách: 

Chapter 8 - Microbial production of butanol from food industry waste, in Food Industry Wastes: Assessment and Recuperation of Commodities, Patakova P. , Branska B. , Lin Z. , Wu P. , Zhou Y. , Drahokoupil M. , Liu H. , Zhang J., Melzoch K. 2nd edition, Kosseva V., Webb C. (eds.), Elsevier, Academic Press, 2020, Pages 163-180, ISBN 9780128171219, https://doi.org/10.1016/B978-0-12-817121-9.00008-5. 

Comparison of Suspended and Surface-immobilized Clostridium pasteurianum 

Cultures Performance during Continuous Butanol Production 

Branska B., Patakova P., Melzoch K. In: BIOREFINING in the 21st Century,  Editors: Olga Šolcová, Jiří Hanika, Pavel Topka, ISBN: 978-80-86186-02-3 

Application of Flow Cytometry in Analysis of Fitness of Microbial Producers 

Vasylkivska M., Branska B., Patakova P. In: BIOREFINING in the 21st Century,  Editors: Olga Šolcová, Jiří Hanika, Pavel Topka, ISBN: 978-80-86186-02-3 

Patakova P, Branska B, Patrovsky M. Monascus Secondary Metabolites. In: Merillon J-M, Ramawat GK, editors. Fungal Metabolites. Cham: Springer International Publishing; 2016. p. 1–31 

Aplikované výstupy 

Patenty: 

Patáková P., Branská B., Paulová L., Stiborová H., Lovecká P. a další ,  Úplné kultivační médium pro mikrobiální produkci etanolu nebo butanolu, způsoby jeho výroby a způsoby výroby etanolu a butanolu, CZ Patent č.306795, VŠCHT Praha, Briklis s.r.o., EcoFuel Laboratories, s.r.o., datum udělení 30.5. 2017.  

Lovecká P., Vrchotová B., Demnerová K., Stiborová H., Patáková P., Branská B., Kaštánek P., Jandejsek Z., Fulín T.,  Způsob produkce polyhydroxyalkanoátů z vedlejších živočišných produktů. CZ Patent č. 308902, datum udělení 7.7. 2021. 

Užitné vzory: 

Drahokoupil M., Branská B., Paulová L., Patáková P., Melzoch K., Kaštánek P., Kronusová O., Jandejsek Z. Zařízení pro odběr suspenzních anaerobních vzorků z bioreaktoru. PUV 2018-35299 

Branská B., Patáková P., Stiborová H., Lovecká P., Demnerová K., Melzoch K., Jandejsek Z., Kaštánek P. Živná složka kultivačních médií pro mikroorganismy. PUV 2019-36153. 

Branská B., Patáková P., Melzoch K., Jandejsek Z. Probiotický přípravek pro psy na bázi vedlejších živočišných produktů. Užitný vzor, PUV 2022-39725, UV 36 249, zapsán 9.8. 2022 

Funkční vzorek, Gfunk: 

Branská B., Hajlová J., Jírů J., Kolek J., Melzoch M., Patáková P., Patrovský M., Paulová L., Stránská M., kaštánek P., Svátek A.  Úplné kultivační médium pro mikrobiální produkci etanolu nebo butanolu. 2016 Fukční vzorek: RIV/60461373:22330/16:43913484 

Branská B., Drahokoupil M., Melzoch K., Patáková P.,, Hybridní bioreaktor pro kontinuální produkci mléčné kyseliny z odpadních surovin v kombinovaném submersním a imobilizovaném uspořádání. Funkční vzorek: RIV/60461373:22330/19:43918374 

Branská B., Melzoch K., Patáková P., Jandejsek Z.. Probiotický přípravek pro psy vyrobený ze zbytků po enzymové hydrolýze vedlejších živočišných produktů, 2020, Funkční vzorek RIV/60461373:22330/20:43921121. 

Branská B., Melzoch K., Patáková P., Jandejsek Z. Probiotického přípravku pro psy z hydrolyzátu VŽP ze zpracování drůbeže. Funkční vzorek, 2021. RIV/60461373:22330/21:43922815 

Ověřené technologie:

Paulová L., Branská B., Melzoch K. - Zavedení technologie přítokované kultivace kvasinky Pichia pastoris pro produkci rekombinantího proteinu (2008). Ověřená technologie. RIV/60461373:22330/08:00021084 

Branská B., Patáková P., Drahokoupil M., Melzoch K., Přímé zpracování obtížně fermentovatelných lignocelulózových hydrolyzátů na biobutanol přítokovanou kultivací. 2019, Ověřená technologie. RIV/60461373:22330/19:43918377Smlouva o využití výsledků výzkumu a vývoje č.107-2019.  

 Poloprovozy: 

Branská B., Drahokoupil M., Patáková P., Vasylkivska M., Paulová L., Melzoch K., Jandejsek Z., Fulín T., Svátek A., Kaštánek P.: Hydrolýza a frakcionace lignocelulosových materiálů. Poloprovoz. 2017 RIV/60461373:22330/17:43913302 

Drahokoupil M., Branská B., Vasylkivska M., Patáková P., Melzoch K., Jandejsek Z., Fulín T., Kaštánek P., Svátek A. Produkce kyseliny mléčné ze zemědělských a potravinářských odpadů, Poloprovoz., 2018. RIV/60461373:22330/19:43918379 

Zájmy 

Hory a bílé víno.